《地表水環境質量標準》（GB3838-2002）按照功能高低將水體劃分為五類：
Ⅰ類主要適用于源頭水、國家自然保護區；
Ⅱ類主要適用于集中式生活飲用水地表水源地一級保護區、珍稀水生生物棲息地、魚蝦類產卵場、幼魚的索餌場等；
Ⅲ類主要適用于集中式生活飲用水地表水源地二級保護區、魚蝦類越冬場、洄游通道、水產養殖區等漁業水域及游泳區；
Ⅳ類主要適用于一般工業用水區及人體非直接接觸的娛樂用水區；
Ⅴ類主要適用于農業用水及一般景觀要求水域。
《海洋水質標準》（GB3097）按照海域的不同使用功能和保護目的，將海水水質分為四類：
第一類適用于海洋漁業水域，海上自然保護區和珍稀瀕危海洋生物保護區；
第二類適用于水產養殖區，海水浴場，人體直接接觸海水的海上運動或娛樂區，以及與人類食用直接有關的工業用水區；
第三類適用于一般工業用水，濱海風景區；
第四類適用于適用于海洋港口水域，海洋開發作業區。

排入《地表水環境質量標準》 Ⅲ類（規定的保護區和游泳區除外）和《海洋水質標準》中二類海域的污水執行一級標準。排入Ⅳ、 Ⅴ類水域和三類海域的污水，執行二級標準。排入設置二級污水處理廠的城鎮排水系統的污水，執行三級標準。
GB3838中Ⅰ、Ⅱ類水域和Ⅲ類水域中劃定的保護區，GB 3097中一類海域，禁止新建排污口，現有的排污口應按照水體功能要求，實施污染物總量控制，保證受納水體水質符合規定用途的水質標準。

將排放的污染物按照性質和控制方法可分為兩類
第一類污染物，不分行業和污水排放方式，也不分受納水體的功能類型，一律在車間或車間處理設施排放口采樣，其允許排放濃度達到本標準要求（共13項）；
第二類污染物，在排污單位排放口采用，其允許排放濃度必須達到本標準要求